Top
IDMSMg01-261K04
Information of forward sequence (DDBJ: AG403964)
Chromosome 11 position(base) 75237260 - 75237933 strand +
Alignment
seq1: chr11_75237260_75237933
seq2: MSMg01-261K04.T7_53_717

seq1  ATTCATCAGTTTCCTATACCGCTGACTACACAGGGGCTGAAGGTAATCTC  50
      |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATCAGTTTTCTATACCGCTGACTAC-CAGGGGCTGAAGGTAATCTC  49

seq1  AATGTTTTCATAACTGGTGTGGTGCTACTTGCTCATGATCCCAACACTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTTTTCATAACTGGTGTGGTGCTACTTGCTCATGATCCCAACACTTG  99

seq1  GAAGGTAGGTCAGAAGTTCAAGAGCAGTCTTGACTACTCAGTGAATTTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTAGGTCAGAAGTTCAAGAGCAGCCTTGACTACTCAGTGAATTTGA  149

seq1  GGCTAGCCTGGGCTACATGAAAACTCATAAAACAATAAAAGAAAAGAAAA  200
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GGCTAGCCTGGGCTACATGAAAACTCATAAAACAATGAAAGAAAAGAAAA  199

seq1  GGTGGCGAGTGAGGTGGCCCATCAGGTAAAAGTGCCAACCACCTCGCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGCGAGTGAGGTGGCCCATCAGGTAAAAGTGCCAACCACCTCGCCTG  249

seq1  AAAGCCTCCACACGGAAGGGGAAAGCCAGCTTCTACATGTGGTCCTCTGC  300
      |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCCTCCACACGGAAGGTTAAAGCCAGCTTCTACATGTGGTCCTCTGC  299

seq1  CCTCCGCATGCACCATGGCTCGTGCACCCCCACACCCACCCACCCACCCA  350
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||
seq2  CCTCCGCGTGCACCATGGCTCGTGCACCCCCA--------CACCCACCCA  341

seq1  CCCACATGACATAAATACTTGTAATGATTAGTTTCTGAAGAACAATATTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACATGACATAAATACTTGTAATGATTAGTTTCTGAAGAACAATATTT  391

seq1  TCGTTGATCTTGTTTAGGGAACAAAGTTCGTGCACATTGACCTGTCGACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTTGATCTTGTTTAGGGAACAAAGTTCGTGCACATTGACCTGTCGACC  441

seq1  GTGTAGTACGGGATCCGCTCCAGGAAGCTAAAGATTTTGGGATGCTTCAT  500
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAGTACGGGATCCGCTCCACGAAGCTAAAGATTTTGGGATGCTTCAT  491

seq1  GTTGCAGCTACTCTGATGAACAGTGTTG-CTTTCTGGGCCAGGTAATGGT  549
      |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||||||||
seq2  GTTGCAGCTACTCTGACGAACAGCGCTGCCTTTCTGGGTCAGGTAATGGT  541

seq1  GGCATATACCTTTGATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAAGCATGTAGATCTC  599
      |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||
seq2  GGCATATACCTTTGATCCCAGCACTTGGGAGCGCGAAGCATGTAAATCTC  591

seq1  TGTGAGTTCGAGATCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGATATCCAA  649
      ||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||    | || || |||| 
seq2  TGTGTATTCGAGATTAGCCTGGTCCACATAGTGTAGCCAAGAATTTCCAG  641

seq1  GGCTATACAGAAAAACCCCTGTCTC  674
      | |||| || ||  |||||||||||
seq2  GTCTATCCA-AATTACCCCTGTCTC  665

Information of reverse sequence (DDBJ: AG403965)
Chromosome 11 position(base) 75322128 - 75322694 strand -
Alignment
seq1: chr11_75322128_75322694
seq2: MSMg01-261K04.TJ_69_637 (reverse)

seq1  TGGGATGGGGAGAAGACTATTATCATCACGTGCAGGTTGGTGTGGGCCTC  50
      ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATGGGAAGAAGACTATTATCATCACATGCAGGTTGGTGTGGGCCTC  50

seq1  TTGGGTGGAAATATTATAGAGCAGGCATTGCAGGCCAGG-ACCTGGATTG  99
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||
seq2  TTGGGTGGAAATATTATAGAGCAGACATTGCAGGACAGGAACCTGGATTG  100

seq1  GTGGCTTGAGCGCTTACCCTGTCCCTGTCCCCCCCACCCCAGCTTCACAC  149
      ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTTGAGCGCTTACTCTGTACCTGTACCCCCCACCCCAGCTTCACAC  150

seq1  CAGGCTCCTGCACACTGACAGCCTACAAGCTGACACCCAGTGGGTATGAG  199
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CAGGCTCTTGCACACTGACAGCCTACAAGCTGACGCCCAGTGGGTATGAG  200

seq1  TGGGGCCGGCAGAACACAGACAAAGGCAACAACCCCAAAGGCTACCTACC  249
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTCCGGCAGAACACAGACAAAGGCAACAACCCCAAAGGCTACCTACC  250

seq1  CTCGCACTACGAGAGGGTTCAGATGCTCCTGTCTGACCGATTCCTCGGCT  299
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGCACTACGAGAGGGTTCAGATGATCCTGTCTGACCGATTCCTCGGCT  300

seq1  TCTTCATGGTCCCCGCCCAGTCCTCCTGGAACTACAACTTTATGGGTACG  349
      |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCATGGTCCCCGAACAGTCCTCCTGGAACTACAACTTTATGGGTACG  350

seq1  TGGTTGTGTGTGCCTAGGAAGTGTGGGGTAGAGACAGGTGACCAGCATGC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTGTGTGTGCCTAGGAAGTGTGGGGTAGAGACAGGTGACCAGCATGC  400

seq1  TTGGTCATCTTGTCATCTTGAGGTCTGGCTGCCTTGGAAACGGTCCAGGG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TTGGTCATCTTGTCATCTTGAGGTCTGGCTGCCTTGGAAACGGCCCAGGG  450

seq1  GCCCAGGCTGGGTGAGGCAGGCAGAACCTTATTAACTTCTGATGTTTCCC  499
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGGCTGGGTGAGACAGGCAGAACCTTATTAACTTCTGATGTTTCCC  500

seq1  CTCCCATTAGGTGT-TCGACATGATCCCAACATGAAATACGAGCTGCAGC  548
      ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCATTAGGTGTGGCGACATGATCCCAACATGAAATACGAGCTGCAGC  550

seq1  TGGCAAACCCCAAGGAATT  567
      |||||||||||||||||||
seq2  TGGCAAACCCCAAGGAATT  569