| Information of forward sequence (DDBJ: AG302000) |
| Chromosome |
18 |
position(base) |
42700014 - 42700672 |
strand |
+ |
 |
| Alignment |
seq1: chr18_42700014_42700672
seq2: MSMg01-081G04.T7_47_701
seq1 GAATTCTTTTTGAAGATTTTACTTATTCATTAAATGTATGTCTGCACTAT 50
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCTTTTTG-ACATTTTACTTATTCATTAAATGTATGTCTGCACTAT 49
seq1 AGCTGTCTTTAGACACATCAGAAGAAGGCATCGGATCCCATTGCATATGG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGCTGTCTTTAGACACATCAGAAGAAGGCATCGGATCCCATTGCATATGG 99
seq1 TTTTGAGTCTCCATGTGGTTGCTGGGAATTGAAGTTAGGACCTCTGGAAG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTTGAGTCTCCATGTGGTTGCTGGGAATTGAAGTTAGGACCTCTGGAAG 149
seq1 GGCAGTCATTGCTCTTAGCCTCTGAGCCATCTCTCCTGTCCTTCTTATGA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCAGTCATTGCTCTTAGCCTCTGAGCCATCTCTCCTGTCCTTCTTATGA 199
seq1 TTTTTATCTTTAGGTTTTTCTTCATCATTGACCGTCTAAGTTATGTAGTG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTTTATCTTTAGGTTTTTCTTCATCATTGACCGTCTAAGTTATGTAGTG 249
seq1 ATTTTTTTTTTTTTCCTTAAGGAGAGGTATGGGTTGAAAATGGAAGAGGG 300
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 A---TTTTTTTTTTCCTTAAGGAGAGGTATGGGTTGAAAATGGAAGAGGG 296
seq1 CTGAAGATGCCTTCCCAATCTGATATTCTCAGCGGGGCAGATGTAAAAAG 350
|||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
seq2 CTGAAGATGCCTTCCCAATCTGATATCCTCAGCAGGGCAGATGTAAAAAG 346
seq1 CAAAGCAATGAGTGAGGAGTGTCGGCCTTCTGGGCCTGTGACTTCCACAT 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAAAGCAATGAGTGAGGAGTGTCGGCCTTCTGGGCCTGTGACTTCCACAT 396
seq1 CAGCAGTCTAACAAATCTGTTAAACCAGTGATTCTCAACCTGTGGGGTTA 450
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2 CAGCAGTCTAACAAATCTGTTAAACCAGTGATTCTCAACCTGCGGGGTTA 446
seq1 CATATCAGATATCCTTCATCTCAGAGATTCACATTATGATGTATAACTAG 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CATATCAGATATCCTTCATCTCAGAGATTCACATTATGATGTATAACTAG 496
seq1 CAAAATTACAGGTATGAGATAGTAATGAAAATAATGTTATGGTTGGGGTC 550
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAAAATTACAGATATGAGATAGTAATGAAAATAATGTTATGGTTGGGGTC 546
seq1 ATCACAACATGAGGAGCTGTATTAAAGGGTCACAGCATTAGGAAGGCTGA 600
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATCACAGCATGAGGAACTGTATTAAAGGGTCACAGCATTAGGAAGGCTGA 596
seq1 CAACCTCTGCCTTAAATGGATTGTTACTCCAGGCCACTGATATCCATCTA 650
| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTACCTCTGCCTTAAATGGATTGCTACTCCAGGCCACTGATATCCATCTA 646
seq1 TCTCACCTA 659
||||| |||
seq2 TCTCATCTA 655
|
|
| Information of reverse sequence (DDBJ: AG302001) |
| Chromosome |
18 |
position(base) |
42776402 - 42777042 |
strand |
- |
 |
| Alignment |
seq1: chr18_42776402_42777042
seq2: MSMg01-081G04.TJ_62_699 (reverse)
seq1 ATATGGGTTTGAATCAGCACTATACAAAAATTCATGGGATAGAAAATTTC 50
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||
seq2 ATATGGGTTTGTATCAGTACTATACAAAAATTCATGCGATAGAAAATGTC 50
seq1 ATACAACTTTAAGCAAACTGTCTTTGAATAAAACTGGGAAGTGGACTGGG 100
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATACAAATTTAAGCAAACTGTCTNTGAATAAAACTGGGAAGTGGACTGGG 100
seq1 TTTGTGTCATTGGCCTCTGTGACAGCCAGGCTCAAAGCCCCCAGCTAGCA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTGTGTCATTGGCCTCTGTGACAGCCAGGCTCAAAGCCCCCAGCTAGCA 150
seq1 CCTGGCTTCCCTCTTCTGCTTTGTCTATATCTTCTTCTATTTAGAGGTGT 200
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2 CCTGGCTTCCCTCTTCTGCTTTGTCTATA---TCTTCTATTTAGAGGTGT 197
seq1 GTGTATGTGCGTGCACATGTGTGTCTGAGGTATGCACACATTTTTAATAC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGTATGTGCGTGCACATGTGTGTCTGAGGTATGCACACATTTTTAATAC 247
seq1 TTCTGACATTGGTATAATCTTTTTACAATTATTTAATATTTTTATTATTT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCTGACATTGGTATAATCTTTTTACAATTATTTAATATTTTTATTATTT 297
seq1 TTGAGGCTAAAATATAATTGCTATCCCCATTCCTTTTCCTCCTGCCAGCC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGAGGCTAAAATATAATTGCTATCCCCATTCCTTTTCCTCCTGCCAGCC 347
seq1 CCTCCATATGTCCTCTTGTGCTCTCTCAAATTCATGATCTGTTTGTCTTT 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTCCATATGTCCTCTTGTGCTCTCTCAAATTCATGATCTGTTTGTCTTT 397
seq1 AATTGCTGATATTATATATATGATATCAGCATATATTACCAGTATGTATA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATTGCTGATATTATATATATGATATCAGCATATATTACCAGTATGTATA 447
seq1 TGATATTACCTGTATGTAAACGACTTCAGGGTTGGGACCTCTTCCCCAGG 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGATATTACCTGTATGTAAACGACTTCAGGGTTGGGACCTCTTCCCCAGG 497
seq1 GAAGGCGATTTCTCCTACTCCTTCCATTGTCTAGTTGCTTGTAAGATTCA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAAGGCGATTTCTCCTACTCCTTCCATTGTCTAGTTGCTTGTAAGATTCA 547
seq1 TGCCACAGGATCTCTCCCTTTTTCATGTGACATGTCTCTTGATGTGGTCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCCACAGGATCTCTCCCTTTTTCATGTGACATGTCTCTTGATGTGGTCT 597
seq1 TTGTTCAGATCTTGTTTAGGCAGCCATGCTGGTGAGAATTC 641
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGTTCAGATCTTGTTTAGGCAGCCATGCTGGTGAGAATTC 638
|
|